Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRKRIP1Q9H875 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms