Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD4Q9H223 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD4Q9H223 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms