Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDCBP2Q9H190 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms