Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTDSP1Q9GZU7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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