Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLIRPQ9GZT3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms