Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE41Q9C0J9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE41Q9C0J9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms