Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPEF2Q9C093 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPEF2Q9C093 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms