Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms