Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCGF6Q9BYE7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCGF6Q9BYE7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms