Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5DQ9BY66 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5DQ9BY66 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms