Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KATNB1Q9BVA0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms