Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF1Q9BSM1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF1Q9BSM1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms