Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDHD3Q9BSH5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDHD3Q9BSH5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDHD3Q9BSH5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDHD3Q9BSH5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDHD3Q9BSH5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDHD3Q9BSH5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDHD3Q9BSH5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDHD3Q9BSH5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDHD3Q9BSH5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms