Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FYCO1Q9BQS8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FYCO1Q9BQS8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms