Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRBNQ96SW2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRBNQ96SW2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms