Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF607Q96SK3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms