Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBL7Q96S82 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBL7Q96S82 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UBL7Q96S82 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBL7Q96S82 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBL7Q96S82 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBL7Q96S82 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBL7Q96S82 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBL7Q96S82 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms