Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF12Q96QT6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF12Q96QT6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms