Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP3Q96P20 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP3Q96P20 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms