Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMD11Q96NU1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMD11Q96NU1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms