Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms