Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms