Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP44Q96MT7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP44Q96MT7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms