Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms