Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIN37Q96GY3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms