Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIRT1Q96EB6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms