Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG4CQ96DT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms