Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM54Q969K7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM54Q969K7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms