Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATRIPQ8WXE1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATRIPQ8WXE1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms