Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUFY2Q8WXA3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms