Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF4Q8WV16 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms