Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX29Q8TEQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms