Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms