Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00301Q8NCQ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00301Q8NCQ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms