Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN19Q8N6F1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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CLDN19Q8N6F1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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CLDN19Q8N6F1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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