Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL34Q8N239 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL34Q8N239 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms