Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NME9Q86XW9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms