Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT27Q7Z3Y8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT27Q7Z3Y8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms