Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SV2AQ7L0J3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms