Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTU2

EP400NL, EP400 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400NLQ6ZTU2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EP400NLQ6ZTU2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms