Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP47Q6ZTR5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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