Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC129Q6ZRS4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms