Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LIAT1Q6ZQX7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms