Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC171Q6TFL3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms