Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LETMD1Q6P1Q0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms