Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KANK3Q6NY19 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KANK3Q6NY19 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms