Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC8EQ6NSJ5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC8EQ6NSJ5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms