Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD40Q6AI12 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms