Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms