Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms